Búsqueda de secuencias

	Búsqueda de secuencias de ADN paso a paso


Práctica	Búsqueda de una secuencia de consenso para la beta-Hemoglobina humana utilizando Entrez.

	MODO OPERATIVO: A lo largo de la práctica, las imágenes del margen izquierdo son muestras de los pasos que se indican a la derecha. Es muy recomendable cerrar inmediatamente las ventanas que se abren para visualizar estas muestras para evitar saturación de ventanas abiertas en la barra de tareas. Se indican en negrita y entre corchetes, [Así], las pulsaciones de botones o enlaces de otro tipo y en letra cursiva las introducciones de texto en campos de formulario.

		Pulsa el icono de la izquierda, [Entrez], para acceder al entorno de búsquedas del NCBI. La ventana que aparece es el entorno que da acceso a las diferentes bases de datos en los que está organizada la información. El sistema de hiperenlaces hace que podamos llegar al mismo resultado siguiendo diferentes caminos.

		Vamos a utilizar los datos de la base de datos de Herencia Mendeliana Humana En-Línea. [OMHM] (clic Fig. izq.)

		Escribimos el identificador de nuestra búsqueda (hbb) y pulsamos [go].(clic Fig. izq.)

		En el listado que obtenemos podemos ver como primer resultado el correspondiente a la beta-hemoglobina, incluyendo dos enlaces, el primero es una referencia que nos conduce a una página con nutrida información sobre el locus. Pulsamos el segundo [11p15.5] que enlaza con un mapa citogenético. (clic Fig. izq.)

		Seguidamente el mismo enlace en la tabla que aparece [11p15.5]. LLegaremos así a visualizar el mapa. En el margen de la izquierda disponemos de elementos de navegación que nos permiten ampliar o reducir la zona visualizada del cromosoma en cuestión. Hacemos clic para reducir esa zona [zoom out] (clic Fig. izq.)

		En modo de visión del cromosoma entero, el primer locus corresponde al buscado. Pulsamos sobre su identificador [HBB] para acceder a toda la información disponible. (clic Fig. izq.)

		Entre los datos a los que podemos acceder están las zonas codificantes, intrones, regiones no traducidas, etc. Buscamos la posición de la página en donde se disponen los accesos a las secuencias, entre ellas la secuencia consenso (podemos utilizar la utilidad Edición>Búsqueda en esta página introduciendo el el campo de búsqueda "NCBI Reference Sequences" (clic Fig. izq.)

		Al final de la página obtenida localizaremos la secuencia buscada.

		Copia y pega la secuencia y guárdala en un documento de texto creado a tal efecto con el programa 'Bloc de notas' de Windows.